Surge esta Cofradía denominada en ese tiempo "de San Juan Evangelista",en el año 1.955, formada por un reducido número de jóvenes marteños, con el propósito de venerar la imagen de San Juan Evangelista y procesionar junto a Nuestro Padre Jesús Nazareno el Viernes Santo. También se tiene constancia que esta imagen acompañaba a Nuestro Padre Jesús Nazareno desde los últimos años del siglo XVIII hasta llegar a la Guerra Civil Española, en que la imagen sufrió destrozos, pero se convirtió en una de las pocas imágenes marteñas que fue rescatada de ese acontecimiento histórico. Su procedencia es atribuida a la escuela del escultor Salcillo, con algunos rasgos que podrían adaptarse perfectamente al propio escultor. De la talla de San Juan Evangelista destaca la belleza de su rostro y la perfección de sus manos. Durante los años 1.973-74 esta Cofradía sufre un período de abandono, siendo nuevamente reorganizada en el año 1.975 por otro grupo de jóvenes marteños, que le darían el empuje definitivo hasta el día de la fecha. Los primeros estatutos fueron confeccionados durante los años 1.979 y 80. Finalizada la procesión del Viernes Santo del año 1.986, la Junta Directiva mostró su interés de colaborar con la Cofradía de Nuestro Padre Jesús Nazareno, María Santísima de los Dolores y María Magdalena para mejorar la procesión en general, acordando solicitar la cesión de la imagen de María Magdalena, y en reunión celebrada el día 12 de Octubre de 1.986 entre ambas Juntas Directivas y el Párroco de Santa Marta, se llegó al acuerdo de ceder la imagen de María Magdalena a la Cofradía de San Juan Evangelista, para procesionarla y rendirle culto, constituyéndose hasta el día de la fecha la Cofradía de San Juan Evangelista y Santa María Magdalena